男性尖锐湿疣和女性尖锐湿疣的不同处主要是发生部位不同。因为男性的生殖器都是外露的，尖锐湿疣主要长在会阴部位及阴茎等部位，比较容易被发现。而女性的生殖器都是长在里面的，不容易被发现，可能引起宫颈等部位有疣体，而且还可刺激阴道，使女性的阴道分泌物增多，并伴有瘙痒等症状。
另外，女性感染尖锐湿疣后，发生癌变的可能性要比男性大，因为女性的尖锐湿疣多发生在宫颈周围，如果感染高危型病毒，会增加女性患宫颈癌的几率。
