尖锐湿疣的治疗原则为清除疣体、改善症状、预防复发。局部去除疣体可以使用辅助抗病毒和提高免疫功能的药物，或者酌情选用激光、冷冻、电灼等物理治疗清除病损，必要时可以选择手术切除，但手术切除也有可能增加尖锐湿疣的扩散概率。
尖锐湿疣在去除疣体后，多数患者病毒可以藏身于尿道向外阴播散，导致频繁反复发作。为减少该疾病的反复发作，应提升患者性生活健康教育，少熬夜、减少性生活频次，辅以外用药膏治疗，可以使用综合治疗的办法提高自身免疫力。
