川崎病的预防主要是预防免疫功能紊乱以及预防感染。
川崎病目前考虑与免疫以及感染有关系，但是具体发病机制还不是特别明确。建议尽早预防免疫紊乱以及预防感染，可以明显降低发生川崎病的概率。
部分川崎病症状不典型容易被忽略，从而错失最佳治疗时间。所以一般建议反复高热五天以上的孩子，需要高度警惕川崎病的可能，建议尽早进行炎症指标以及心脏超声等检查明确。尽量在发病10天内使用免疫球蛋白，可以明显降低发生冠状动脉损害的概率。
