原发性膀胱结石多因营养不良所致。继发性膀胱结石主要继发于肾或输尿管结石，与膀胱异物、下尿路梗阻、尿路感染、体内代谢异常等原因有关。
儿童原发性膀胱结石主要由营养缺乏、动物蛋白摄入不足导致。继发性膀胱结石可能与出现良性前列腺增生、尿道狭窄等有关。若尿流不畅，尿盐沉淀不随尿流排出，沉积于膀胱而形成结石。若膀胱内若有异物可作为结石的核心，使尿盐晶体物质沉积于其周围，最终形成结石。此外，继发于尿液潴留及膀胱异物的感染，使尿pH升高，导致尿磷酸钙、铵和镁盐的沉淀而形成膀胱结石。代谢性疾病也可造成结石。肠道膀胱扩大术后可发生膀胱结石。服用某些药物也可诱发。
