室间隔缺损手术并发症主要有伤口感染、残漏、修补部位发炎,还有可能发生传导障碍等,具体如下:1、室间隔缺损手术属于有创手术,可能会出现伤口感染、出血的情况。2、室间隔缺损修复手术也可能出现修补不严密,修补部位出现残漏的情况。若残漏口小于2mm,多数情况下可以自愈。如果有较大残漏分流的症状,需要再次手术修复。3、手术修补的地方可能会出现发炎的情况,如细菌性心内膜炎。4、可能发生传导障碍,如右束支传导阻滞或者完全性房室传导阻滞等并发症。