新生儿半夜哭闹不止的原因具体如下：
1.生理性原因。比如半夜宝宝饥饿、大小便后尿布浸湿、衣被太厚太热或太薄过凉、长时间未更换体位肢体不适、蚊虫叮咬引起瘙痒等，均可引起哭闹。
2.皮肤疾病引起。比如新生儿患有湿疹，会在半夜温度比较高、出汗时导致宝宝皮肤瘙痒不适，导致半夜哭闹。
3.病理性原因引起。比如新生儿患有神经系统方面疾病、消化系统疾病、呼吸系统疾病等，导致的患儿突然出现鼻塞、发烧、呕吐、腹痛、腹泻等症状，也会导致患儿出现半夜哭闹不止。
出现症状后，家长应及时带患儿去医院进行相关检查，明确病因后进行规范治疗。
