胃肠间质瘤分级即胃肠间质瘤良恶性或复发危险度分级。所有的胃肠间质瘤都有潜在恶性，对于有潜在恶性的肿瘤，判断其手术以后，复发转移概率大小的相应标准有很多，包括国内标准、国际标准。
目前应用相对较多，专家学者较认可的标准，是美国国立卫生研究院的NIH评判标准，主要根据肿瘤发生的部位、肿瘤大小、肿瘤是否有破裂、核分裂象等四个因素进行分类，可以分为极低危、低危、中危、高危，共四个等级。
胃肠道间质瘤是发生于胃肠道、网膜、肠系膜的特异性胃肠道肿瘤。根据其四个等级和肿瘤大小及核分裂，平滑肌的分化类型有可能发生良性肿瘤。神经分化类型多为恶性肿瘤。
