大部分卵巢早衰患者的病因并不明确。目前临床上已经达成共识的可能导致卵巢早衰的原因有以下几种：
一、染色体异常：是卵巢早衰的主要病因之一，主要见于X染色体异常；
二、自身免疫性疾病：比如系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎等；
三、医源性损伤：放疗和化疗对卵巢功能的影响和治疗的范围、药物的剂量、治疗的时间长短密切相关；
四、病毒感染：某些病毒感染会导致卵巢功能的损伤；
五、其他：卵巢肿瘤、接触有毒物质、环境污染、不良的生活习惯等。
