宫外孕最常见的病因为输卵管炎症，受精卵在输卵管损伤的部位被阻挡，在此部位开始生长，由于受精卵未能进入宫腔，所以发生异位妊娠。也可能是输卵管发育异常，输卵管长度约10-14cm，输卵管过长时，发生宫外孕的几率增加。此外，若患者之前有过输卵管妊娠，再次妊娠史，异位妊娠的几率可高达10%左右。也可能和避孕失败有关，例如使用宫内节育器避孕失败或口服紧急避孕药物失败，发生异位妊娠的几率较大。
