生殖器疱疹经过积极治疗，症状和皮损是有可能完全消除的，但不能根治，极有可能反复发作到老年。
生殖器疱疹是通过性接触传播的复发性慢性疾病，即使不用药治疗，在生殖器上出现疱疹后，一般1~2周的时间可自行恢复，因此属于自限性的病毒感染性疾病。但此病容易反复发作，若有过生殖器疱疹的病史，一旦出现了发烧、扁桃体发炎或过度劳累等诱因导致身体的抵抗力低下后，生殖器疱疹就可能复发。所以在感染了生殖器疱疹后，应尽快积极治疗，可以缩短病程，减轻症状，减少复发。
感染了疱疹病毒后，随着时间的延长，体内的疱疹病毒数量会有所减少，复发次数也会逐渐减少。
