判断肛周湿疹主要是通过肛门的望诊，可以到肛肠科或者是皮肤科进行检查。肛周湿疹可以引起肛门周围皮肤的红肿刺痛，另外，还会形成一些小的皲裂口。此外，该病和其他疾病有相似之处需要注意鉴别，比如扁平湿疣，患者多因不洁性交后引起梅毒，最初表现为肛周红斑、丘疹、糜烂、潮湿，但是无瘙痒症状。扁平湿疣进行分泌物化验时，可观测到梅毒螺旋体。而肛周蛲虫或者是病蛲虫感染，亦可引起肛周瘙痒，但化验时可检测到虫卵。
