子宫颈上皮,包括两种:宫颈外口的鳞状上皮和宫颈管内的柱状上皮。子宫颈潴留囊肿大多数情况下是子宫颈的生理性变化,子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中,新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或伸入腺管,将腺管口堵塞,导致腺体分泌物引流受阻,潴留形成囊肿,子宫颈局部损伤或者子宫颈慢性炎症,使腺管口狭窄也可导致子宫颈潴留囊肿的形成。