多囊卵巢综合征发病原因尚未明确，现代医学认为，多囊卵巢综合征病因学包括非遗传理论和遗传理论两种：
1.非遗传学理论：研究认为孕期子宫内激素环境影响成年后个体的内分泌状态，孕期暴露于高浓度雄激素环境下，如母亲PCOS史、母亲为先天性肾上腺皮质增生症高雄激素控制不良等，青春期后易发生排卵功能障碍。
2.遗传学理论：此理论的主要根据PCOS呈家族群居现象，家族性排卵功能障碍和卵巢多囊样改变提示该病存在遗传基础。
