引起生化妊娠的原因既有可能来自父母双方，也有可能是胚胎本身的问题。其中，胚胎因素包括：染色体异常，病毒感染、胚胎质量差等。母亲因素包括：子宫形态异常、子宫内膜炎；激素水平异常，雌二醇和促黄体生成素水平较低；多次流产史；长期接触化工产品，接触有毒物质和放射线；如高血压等自身疾病。父亲因素包括精子染色体异常。引起生化妊娠的原因众多，备孕夫妇应做好孕前查体，优生优育。
