药流应用两种药物是米非司酮和米索前列醇。药流反应也因人而异。大部分的人没什么反应，部分人由于药物对胃肠道的刺激会有轻度恶心、呕吐、厌油腻的现象出现。
米索前列醇使子宫兴奋收缩反应会非常明显，剧烈的子宫收缩或痉挛，恶心、呕吐更明显，或有腹泻、排便。个别人可能发生血管性过敏性反应，如皮肤瘙痒、手部瘙痒。
药流不干净会出现恶心、厌油腻、下腹酸痛、阴道持续出血、感染，合并感染阴道分泌物有异味，可伴有发烧，女性进行药物流产一周左右要及时去医院进行彩超检查，有残留要立即进行清宫手术。药物流产期间要注意休息，注意保暖，饮食均衡。
