药物流产的危害主要表现在这几个方面：一、容易感染，药流后阴道流血时间比较长，一般在2周左右，感染的机会相对较大，容易发生子宫内膜炎和盆腔炎；二、药流容易发生流产不全，这样就会需要清宫手术，会造成二次伤害；三、药流多服用米非司酮片和米索前列醇片，一些女性在服用米非司酮后会出现胃肠道反应，如恶心、呕吐，在服用米索前列醇后会出现腹泻、过敏等现象；四、药流后更容易发生内分泌紊乱、月经不调，表现为月经周期的缩短或延长，月经量增多或者减少等。
