孕囊越小并不代表药流越干净，药物流产对孕囊大小是有要求的，一般要求孕囊大小在5mm以上。比如，刚怀孕的时候，孕囊大小在2-3mm左右，此时药物流产，不但药流不干净，还容易导致药物流产失败。药物流产最佳时间是在孕45天以内，很多孕妇在刚刚知道怀孕的时候，想要药物流产，但被告知，孕囊太小，需要回家静养，待孕囊长大之后进行药物流产。另外，药物流产除了B超确定孕囊大小以外，还需要查看孕囊位置，如果孕囊位置不适合药物流产，医生会建议进行清宫手术。
