卵巢早衰目前已经明确的原因有以下几种，一是卵巢及周围脏器手术时损伤了卵巢皮质，造成了卵巢早衰。
二是放疗、化疗等医源性的因素对卵巢皮质造成的不可逆性损伤。三是免疫性的因素对卵巢功能的攻击。四是卵巢早衰有部分女性是由于遗传的因素，也就是染色体的畸变所引起的。
第五，长期的焦虑抑郁等心理因素也会造成卵巢早衰。尽管如此，临床上仍有很多卵巢早衰，目前的医学仍未能发现其致病原因。
