女性的性激素在整个月经周期中会发生周期性的动态变化，所有各个时段的正常值是不同的。如果想评估女性激素基础水平，也就是基础内分泌，需选择在月经第2-4天检查。如想判断是否存在黄体功能不足的情况，需在排卵后黄体中期进行检查孕酮水平（排卵后5-7天）；但在不能肯定阴道流血是否月经，应查激素六项。
月经稀发及闭经者，如尿妊娠试验阴性、阴道B超检查双侧卵巢无大于10mm的卵泡，也可视作基础状态，随时可检测性激素水平，在月经第12-16天（围排卵期）可以检测促黄体生成素、雌激素、孕酮可关注卵泡的生长成熟和排卵情况。所以，女性激素六项的检查，应根据具体检查目的和项目，确定抽血的时间。
