单纯疱疹的治疗主要是缩短它的病程、防止黏膜处继发细菌的感染和减少其复发。外用药物可选择阿昔洛韦凝胶。当皮损渗出较多时,可选用3%硼酸溶液进行湿敷。继发感染时可用用复方多粘菌素软膏。口服药物的选择主要是抗病毒药物。
针对初发型:可使用盐酸阿昔洛韦或盐酸伐昔洛韦,规律口服。对于复发型:最好在出现前驱症状或皮疹出现24小时之内开始口服抗病毒的药物。对频繁复发型1年复发6次以上的患者:可连续口服抗病毒药物6至12个月。