月经干净第二天同房可能会怀孕。对于是否怀孕,首先要明确女性的月经周期是多少天。一般来说,月经周期平均约为28天,如果每个月都是28天,月经期是4天左右,排卵日为下次月经前的14天。如果月经周期恰为28天,则排卵期正好在正中间,也是在月经的第14天,如果在排卵日前后2天至3天同房,则可能怀孕。因此对于月经干净第二天是否会怀孕,则需要看每个人的月经周期及经期天数是多少。建议女性进行早孕试纸自测或到正规医院妇科进行HCG检查,如果HCG升高,则确诊怀孕。