子宫内膜异位症是一种常见的女性妇科疾病，即本应存在于子宫内的组织长到了子宫以外的地方，困扰广大妇女。
目前，子宫内膜异位症确切成因仍不清楚，但是部分学者认为可能跟经血逆流有关。子宫内膜随着月经剥落，但是并未正常排出体外，而逆流后散播在骨盆腔内或是卵巢、输卵管、子宫。
子宫内膜异位症常见的症状为痛经、经血过多、月经来时伴随腹泻或是性交疼痛。子宫内膜异位症若发生在卵巢则常成为巧克力囊肿（chocolate cyst）。
巧克力囊肿因卵巢内经血淤积，过一段时间被氧化成为暗褐色胶状液体如同巧克力，所以称为巧克力囊种。
巧克力囊肿因其内所含的经血氧化，形成许多过氧化物或是自由基，这些化学物质会破坏卵巢内卵子的染色体，染色体被破坏的卵子将无法正常受孕，进而减低子宫内膜异位症病人怀孕的机会。
除了化学物质的破坏，巧克力囊肿也直接破坏卵子，降低卵巢卵子库存量，使女性更年期提早发生，缩短女性尝试受孕的时间。
所以若在初经来潮时没有痛经，而在五年十年后发生痛经的女性，应该及早检查是否有子宫内膜异位症，特别是检查是否有巧克力囊肿，来降低怀孕的困难。
