首先，病史至关重要。
经常能遇到这样的患者：“大夫，您给我开一张精液化验单，我去化验一下。”等化验结果出来后又来找大夫：“结果出来了，您看看这化验单有问题吗？”医生只好仔细解读化验单，而且确实经常能看到化验单基本正常却数年不育的患者。当我们告诉患者结果基本正常后，患者很高兴的拿着化验结果回家了。最后有可能还是圆不了做爸爸的梦。
所以，我们想强调的是：与医生交流病史是至关重要的第一步。其中，不避孕多久太太没有怀孕、性生活频度、勃起及射精是不是正常是病史中最重要的部分。还要了解之前有没有曾经使女性怀孕史、有无可能影响生育的其他病史（如腮腺炎并发睾丸炎、腹股沟疝手术史、隐睾或隐睾复位手术史等），酗酒嗜烟等不良生活习惯史、女方病史（年龄、月经状况、生育史、避孕史、妇科疾病和其他可能影响生育的疾病史）。
其次，医生简单的查体是必不可少的环节。
望诊和听诊，在患者一进门的时候就开始了。我们会注意到患者的胡须、喉结、声音等，就可以基本判断患者的第二性征是不是正常。如果患者说话声音很细、没有胡须，那有可能是性腺（睾丸）发育不全，肯定需要深入检查。
不育最基本的查体，是与医生面对面的生殖器官的检查：触诊，要明确睾丸、附睾、输精管、精索静脉等阴囊内容物的情况，尤其是睾丸的大小和质地，这通常只需要数秒钟的时间即可以完成。
第三，根据病史和查体的情况，有选择的进行辅助检查。
以下这些项目，都是不育症的基本检查项目。
1、精液分析：对于男性不育患者，必须进行至少两次精液分析。精液分析是男性不育症诊断最基础的检查，它包括肉眼观察颜色、量和PH值；显微镜下观察精子计数、活率与活动力以及形态等；精液的生化分析包括果糖、微量元素，应根据特殊需要进行各项有关检测。
2、尿液、前列腺液常规检查及尿液、精液的微生物学检查：据报道，8％～35％不育症与男性生殖道感染性炎症有关，主要为感染导致输精管道阻塞、抗精抗体形成、菌精症、精液中白细胞的作用以及精浆异常。
3、性激素检查：男性不育症患者比正常人更容易出现性激素异常，一般需要检测卵泡刺激素（FSH）、黄体生成素（LH）、泌乳素（PRL）、雌二醇（E2）、睾酮（T）。性激素检查对于判断生精能力及其预后，具有较大的临床意义。
4、其他化验检查：血常规、肝肾功等血液检查有助于发现某些可能对生育造成影响的全身疾病。（如果每年都有例行体检，此项可以不做）
5、生殖系统B超：睾丸具有产生精子和分泌雄激素的功能，所以对男性不育患者阴囊睾丸B超十分重要。前列腺和精囊是男性两个最重要的附属性腺，其分泌物占精液的90%以上，对于精液量少的患者，还需要进行前列腺、精囊腺的超声检查；另外，对于生殖系统疾病尤其是睾丸微石症、睾丸体积与回声、附睾回声以及有无细网状结构改变、有无多发附睾囊肿、精索静脉曲张、肿瘤、鞘膜积液、有无射精管囊肿、精囊腺发育状况等，B超检查都很有价值。
6、人们越来越重视优生优育，但性病的死灰复燃，每年都会有一些胎传梅毒、携带HIV病毒的婴儿出生，使个别家庭的优生优育梦彻底破碎。所以，梅毒、HIV等的筛查也很有必要。
第四，个别患者需要进行特殊检查。
在以上常规检查的基础上，对于无精症、重度少精子症、太太反复胎停育或自然流产、怀疑患有遗传性疾病等患者，为了进一步明确病因和诊断，可考虑选择下列特殊检查：染色体和Y染色体微缺失检查、Torch检查（疱疹、弓形虫、风疹、巨细胞等4种病毒抗体检测）、精子DNA完整性检查等。在以前的医疗实践中，睾丸活检常常是无精症患者病理诊断的首选，但因为睾丸活检毕竟是有创检查，所以现在越来越不被大家所接受。睾丸活检的弊端：一是技术性相对较强，很难在基层开展；二是创伤面积大，术后的出血容易诱发抗精子抗体等并发症；三是所取组织少，不能反映睾丸组织全貌；四是，容易使患者感到痛苦与恐惧。最关键的一点，睾丸活检的患者，本身就生精功能极差，活检所带来的创伤，肯定会进一步损害患者的生精功能，即使穿刺有精子，当做试管时再穿刺很大可能性就穿不出精子了，所以临床中睾丸活检并不常用或已基本被弃用。
以上就是对男性不育患者需要如何进行检查的简单思路总结，患者可以在与医生充分沟通的基础上，根据自身情况选择合适的检查来明确病情，合理治疗。