细菌性龟头炎主要通过实验室检查如涂片镜检发现革兰氏阴性双球菌或培养出细菌确诊，真菌性龟头炎则通过显微镜下观察到菌丝或孢子或真菌培养阳性来鉴别。
临床症状特点方面，细菌性龟头炎常表现为红肿、疼痛、脓性分泌物，有异味；真菌性龟头炎则多为瘙痒明显，分泌物呈豆腐渣样或乳白色，无特殊气味。实验室检查中，细菌涂片可见细菌，真菌涂片可见菌丝孢子；细菌培养阳性可确诊细菌感染，真菌培养阳性可确诊真菌感染。抗生素治疗对细菌性龟头炎有效，抗真菌药物对真菌性龟头炎有效。患者既往有细菌感染史或性接触史可能提示细菌性龟头炎，而近期使用抗生素或免疫力下降可能提示真菌感染。龟头黏膜形态学改变上，细菌性可见糜烂、溃疡，真菌性可见白色膜状物。伴随症状中，细菌性可能伴有尿路刺激症状，真菌性可能伴有外阴阴道炎。
日常应注意保持局部清洁干燥，避免使用刺激性洗液，穿透气内裤，性伴侣同治，避免不洁性行为，及时就医明确诊断并遵医嘱治疗，勿自行用药，定期复查。
