人乳头状瘤病毒的治疗难度因个体情况而异，部分感染可自行清除，而某些高危型感染则需要医疗干预。
人乳头状瘤病毒的治疗效果取决于多种因素，包括病毒类型（低危型通常引起良性病变，高危型可能与癌症相关）、感染部位（生殖器、口腔、咽喉等不同部位的治疗方案各异）、患者免疫力状况（免疫力强的人更可能自行清除病毒）、治疗方法选择（外用药物、物理治疗、手术切除等）、治疗周期（从几周到数月不等）、复发风险（治疗后仍有一定复发可能，特别是对于免疫力低下者）以及预防措施（如接种HPV疫苗、定期筛查等）。综合这些因素，医生会制定个体化治疗方案，而早期发现和规范治疗通常能获得较好效果。
日常生活中，保持良好的个人卫生习惯、增强免疫力、避免与感染者密切接触、定期进行HPV筛查和宫颈癌检查（对女性而言）、接种HPV疫苗以及保持健康的生活方式（如戒烟、均衡饮食、充足睡眠）都是预防和管理HPV感染的重要注意事项。
