大多数男性HPV感染可在6个月至2年内被自身免疫系统清除，实现自愈。
HPV病毒类型决定了自愈时间，高危型可能需要更长时间，而低危型通常较快。个体免疫力是关键因素，免疫系统强健者清除病毒速度更快。感染部位影响自愈进程，生殖器区域感染可能比口腔或咽喉部位持续时间长。出现症状如疣体时自愈可能延长。接种疫苗者有更好免疫反应。健康生活习惯如充足睡眠、均衡饮食、适度运动有助于提高免疫力。年轻人群通常自愈能力更强。感染持续时间越长，完全清除的可能性可能降低。
保持良好卫生习惯，避免与伴侣共用毛巾等个人物品，增强免疫力，定期进行生殖器检查，戒烟限酒，安全性行为，接种HPV疫苗，出现异常症状及时就医，这些措施都能帮助HPV感染更快自愈并减少传播风险。
