假丝酵母菌感染通常不会自愈，需要适当的治疗干预才能彻底清除。
假丝酵母菌感染的自愈可能性受多种因素影响，免疫力正常且轻度感染的患者可能在一段时间后自行缓解，但免疫力低下者如HIV感染者、长期使用免疫抑制剂或化疗患者，感染往往难以自愈并可能加重。感染部位与严重程度也很关键，轻度外阴阴道念珠菌病可能自愈，但口腔或侵袭性感染则必须治疗。是否采取治疗措施直接影响预后，不治疗可能导致慢性感染或反复发作。个人卫生习惯不佳如穿着紧身不透气衣物会增加感染风险并延缓自愈。潜在基础疾病如糖尿病控制不佳会改变阴道环境，促进真菌生长。妊娠状态下雌激素水平升高使女性更易感染且更难自愈。特殊人群如婴幼儿和老年人由于免疫力较弱，感染也较少能自愈。
保持良好的个人卫生习惯，穿着宽松透气的棉质内衣，避免使用刺激性强的清洁产品，均衡饮食增强免疫力，控制好血糖水平，感染期间避免性行为，及时就医并在医生指导下完成全程治疗，不随意停药或使用非处方药物，定期复查以确保彻底治愈。
