尿道内刺痛通常是由尿道炎症、感染或刺激引起的，可能涉及多种病理因素。
尿道内刺痛的原因可分为感染性和非感染性两大类，感染性因素包括尿道炎、前列腺炎等细菌感染，非感染性因素如尿路结石摩擦、外伤、化学物质刺激等。性传播疾病如淋病、衣原体感染也是常见原因。尿道狭窄可能导致尿液排出不畅引起刺痛。神经源性因素如神经功能异常可能放大疼痛感。某些药物副作用如化疗药物可能导致尿道刺激。个人卫生习惯不佳、饮水不足导致尿液浓缩过度清洁破坏尿道自然屏障、过敏反应如对避孕套或润滑剂过敏等都可能引发尿道刺痛。
日常应注意保持充足饮水以稀释尿液，避免刺激性食物和饮料，保持良好个人卫生但不过度清洁，避免使用可能引起过敏的化学产品，出现症状应及时就医并完成全程治疗，避免自行用药掩盖病情，同时注意性伴侣同治以防交叉感染。
