胚胎染色体异常主要由父母染色体异常、环境因素（辐射、化学物质）、母亲高龄、遗传因素、精子或卵子形成过程中的异常以及不明原因导致。
父母染色体异常是胚胎染色体异常的重要原因之一，包括父母一方或双方携带染色体结构或数目异常。环境因素如辐射暴露和接触某些化学物质也可能导致染色体异常。母亲年龄增大，特别是35岁以上，卵子质量下降，染色体不分离风险增加。遗传因素可能涉及家族性染色体异常。精子或卵子形成过程中发生异常会导致胚胎染色体异常。还有部分胚胎染色体异常的原因尚不明确。
对于有染色体异常风险的人群，建议进行遗传咨询，避免接触有害环境因素，保持健康生活方式，定期产前检查，必要时进行产前诊断，如羊水穿刺或无创DNA检测，以早期发现并处理可能的染色体异常问题。
