HPV检测阴性时，TCT检测可能有问题，但并不绝对。
HPV检测阴性仅表明当前未感染常见高危型HPV病毒，或既往感染已被清除，但无法完全排除宫颈病变风险。TCT检测通过观察宫颈脱落细胞形态，可发现炎症、癌前病变或癌变等异常，其结果受多种因素影响。
宫颈炎症是HPV阴性但TCT异常的常见原因。即使未感染HPV，宫颈炎仍可能导致细胞形态改变，引发TCT结果异常。此外，极少数宫颈癌与HPV感染无关，可能与早婚、早育、多产或遗传因素有关，这类病例HPV检测可能为阴性，但TCT会显示异常细胞。
TCT检测的准确性还受取材质量影响。若取材不充分或存在干扰因素，可能影响细胞观察，导致漏诊或误诊。因此，即使HPV阴性，若TCT提示非典型鳞状细胞、低度或高度鳞状上皮内病变等异常，仍需进一步阴道镜检查及活检以明确诊断。
对于HPV阴性但TCT异常的情况，若异常程度较轻，如非典型鳞状细胞意义不明，可观察3-6个月后复查；若提示低度或高度病变，则需立即行阴道镜活检。定期联合筛查HPV和TCT是预防宫颈癌的关键，即使HPV阴性，也应遵循医嘱定期复查，以早期发现潜在病变。
