HPV检测结果正常时，TCT仍可能存在异常情况，但并不绝对。
HPV检测主要针对人乳头瘤病毒感染状态，而TCT是通过显微镜观察宫颈脱落细胞的形态学变化，两者检测目标存在本质差异。即使未感染HPV，宫颈细胞仍可能因其他因素出现异常。
宫颈炎症是导致TCT异常的常见原因之一。长期未愈的宫颈炎可能引发宫颈细胞炎性改变，在TCT报告中表现为反应性细胞变化。此外，非HPV相关的宫颈病变，如化生异常或腺体细胞异常，也可能使TCT结果出现非典型鳞状细胞等异常提示。宫腔操作史同样不可忽视，反复人工流产、分娩或刮宫可能损伤子宫内膜，继发子宫内膜炎，进而影响宫颈细胞形态。
检测技术局限性也是重要因素。TCT取样若未覆盖病变区域，或细胞异型性不显著，可能导致假阴性结果。实验室制片质量、染色效果等环节也可能影响诊断准确性。值得注意的是，极少数宫颈癌病例与HPV感染无直接关联，这类肿瘤的细胞学特征可能被TCT捕捉，但HPV检测无法提示风险。
临床处理需遵循规范流程。若HPV阴性但TCT提示非典型鳞状细胞，建议结合阴道镜检查评估宫颈上皮及血管变化，必要时进行宫颈活检以明确病变性质。对于低度上皮内病变，可采取观察随访策略；高度病变则需根据年龄、生育需求等因素，选择宫颈锥切术等干预措施。定期联合筛查仍是预防宫颈癌的核心手段，建议有性生活女性每3-5年完成一次HPV与TCT联合检测。
