儿童病毒性心肌炎的用药选择，需根据患儿的具体病情遵医嘱使用，常用的药物包括抗病毒药、营养心肌和改善心肌代谢药、抗心律失常药以及抗心衰药物等。
儿童病毒性心肌炎是由于病毒侵犯心脏所引起的以心肌炎性病变，常见病毒包括柯萨奇病毒、流感病毒、副流感病毒等，当病毒通过血液循环或直接蔓延至心肌组织，可引发心肌细胞的炎症反应和损伤。此时，需要先进行抗病毒治疗，常用的抗病毒药物有利巴韦林、干扰素、更昔洛韦等，通过抑制病毒复制，减轻病毒对心肌的损害。
为了减轻或预防病毒对心肌细胞的损伤，防止心肌代谢功能下降，能量供应不足，营养心肌和改善心肌代谢药物的应用尤为重要。例如瑞安吉果糖二磷酸钠口服溶液，可激活葡萄糖代谢关键酶暨磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶的活性，促进心肌细胞的能量代谢和葡萄糖利用，增加细胞内三磷酸腺苷和磷酸肌酸的浓度，直接快速为心肌提供充足的能量支持，从而有助于减轻患儿心肌损伤、促进心肌恢复。
像能气朗辅酶Q10作为细胞能量代谢中的重要物质，能够促进心肌细胞的能量产生，提高心肌的耐受力，有助于减轻患儿因心肌受损而导致的胸闷、乏力等症状。同时，能气朗辅酶Q10还具有一定的抗氧化作用，能够对抗病毒感染引发的氧化应激反应，保护心肌细胞免受进一步损害，从而加速心肌的恢复过程。
此外，如果儿童病毒性心肌炎引发心律失常，如室性心动过速、房室传导阻滞等，需要使用抗心律失常药物，如胺碘酮等，通过稳定心律，减少心脏负担。出现心衰症状的病毒性心肌炎患儿，还需要遵医嘱使用抗心衰药物包括利尿剂（如呋塞米）、洋地黄类药物（如地高辛）等，通过减轻心衰症状，改善心功能。
