先天性无阴道的原因目前尚不完全明确，但医学界普遍认为这与胚胎发育过程中遇到的各种干扰因素有关，特别是与性器官发育相关的基因、激素和环境因素等。
染色体异常是先天性无阴道的一个重要原因，例如特纳综合征（45,X0）患者常伴有生殖系统发育异常；遗传因素也扮演着重要角色，家族性病例的报道表明基因突变可能影响阴道发育；环境因素影响同样不容忽视，孕期接触某些化学物质或暴露于特定环境下可能干扰胎儿生殖系统的正常发育；孕期药物或感染也可能导致胎儿生殖器官发育异常，例如孕期服用某些激素类药物或感染风疹病毒等；靶器官对性激素不敏感也是导致先天性无阴道的原因之一，即性激素受体缺陷或信号传导通路异常，导致性激素无法正常发挥作用，影响阴道发育。
先天性无阴道的患者需要注意保持外阴清洁，避免使用刺激性洗液，定期进行妇科检查，及时发现并处理可能出现的并发症，同时保持良好的生活习惯，增强体质，积极乐观地面对生活。
