取卵手术理论上可能会感染衣原体，但发生的几率很低。在取卵手术过程中，医生会严格遵守无菌操作规程，使用一次性器械，确保手术的安全性。任何医疗操作都无法做到百分之百的无风险。
在取卵手术中，医生会通过阴道穿刺获取卵子，这个过程如果操作不当或者器械消毒不严格，确实有可能导致感染，包括衣原体感染。但现代医疗设备和技术已经能够将这种风险降到最低。正规医疗机构在进行取卵手术前，会对患者进行全面的检查，确保患者没有携带病原体。同时，手术室会进行严格的消毒，医护人员会穿戴无菌衣物，使用一次性手套和口罩，以防止交叉感染。手术器械也会经过严格的高温消毒或者使用一次性器械，从而确保手术的安全性。
为了降低感染的风险，女性在手术前后要注意个人卫生，保持外阴清洁干燥。在手术前，避免进行盆浴和高危性行为，以防感染。手术后，遵医嘱使用抗生素预防感染，并定期复查。如果出现发热、腹痛、阴道分泌物异常等症状，应及时就诊。同时，保持良好的生活习惯，增强免疫力，有助于降低感染的风险。在日常生活中，避免使用公共浴池、游泳池等可能存在卫生隐患的场所，以减少感染的机会。
