月经不调的原因较多，主要包括以下几大类：
主要是各种因素影响下丘脑-垂体-卵巢轴的神经内分泌调节，从而导致月经不调表现。多见于颅咽管瘤、垂体肿瘤、希恩综合征、卵巢肿瘤、多囊卵巢综合征等。此外，糖尿病、甲状腺功能减退或亢进、肾上腺皮质肿瘤等疾病也会导致月经不调。
主要是子宫、卵巢、阴道等部位的炎症、肿瘤及发育异常等引起。常见于子宫内膜异位症、宫颈炎、宫颈息肉、子宫肌瘤、子宫腺肌病、宫颈癌等。
某些血液病，最常见的是血小板减少性紫癜，其他如再生障碍性贫血、白血病等均因血小板质与量发生异常导致月经不调；系统性红斑狼疮由于损伤血管功能，或者因血液抗凝抗体作用而引起月经不调；结核病也常导致患者出现月经不调。
突然或长期精神压抑、紧张、忧虑、情感变化或心理创伤等，都可能会影响下丘脑、垂体等部位功能出现异常，导致痛经、闭经等月经不调表现。
寒冷刺激、不规律饮食、体重下降、长期剧烈运动、过度劳累、吸烟饮酒及某些药物等均可能导致月经不调。
