二价、四价、九价宫颈癌疫苗的区别主要在于预防病毒类型不同、预防功效不同、注射时间不同等。
二价宫颈癌疫苗能预防HPV16型、18型的人乳头瘤病毒感染；四价宫颈癌疫苗可预防HPV16型、18型、6型、11型四种病毒；九价宫颈癌疫苗能够预防HPV6型、11型、16型、18型、31型、33型、45型、52型、58型的人乳头瘤病毒感染。
二价宫颈癌疫苗可以预防70％宫颈癌；四价宫颈癌疫苗可以预防70％宫颈癌、90％尖锐湿疣；九价宫颈癌疫苗可以预防90％宫颈癌、85％阴道癌、50％低级宫颈癌变、90％尖锐湿疣和95％肛门癌等。
二价宫颈癌疫苗注射时间分别是第0、1、6月；四价和九价宫颈癌疫苗的注射时间分别在第0、2、6个月。
值得注意的是，之前九价宫颈癌疫苗接种年龄为16～26岁，经过药监局审批后，九价疫苗接种年龄与二价、四价宫颈癌疫苗的年龄一致，都是9～45岁。
