新生儿乙肝疫苗的接种时间一般在新生儿刚出生24小时之内、之后1个月和出生6个月共3次进行注射。
新生儿乙肝疫苗的注射时间是按照0、1、6个月这个程序进行注射的。如果新生儿的妈妈患有乙肝，出生后应该当天及时注射乙肝疫苗第1支及乙肝免疫球蛋白，以阻断乙肝感染，之后的3针也是按照1个月和6个月进行注射即可。
新生儿接种乙肝疫苗越早越好，出院时医护人员会给一张疫苗接种的卡片，在第1、6个月时，拿着这张卡片和新生儿的医学证明以及家长的身份证到当地的卫生院接种乙肝疫苗即可。
一般情况下，当新生儿出生之后，只要是没有禁忌证，就会给新生儿打第1针的乙肝疫苗。接种3次就能够产生保护性的抗体，一般可以维持3~5年。
