羊水穿刺术通常是有风险的，但是发生风险的概率是比较低的，并没有准确的数值。在做羊水穿刺术前，需要做好充分的准备。
羊水穿刺术的风险通常是流产、感染、胎死宫内等，通常是穿刺过程中刺激子宫收缩造成。风险的高低和每个人的体质有关。比如胎盘的位置，若是胎盘位置处于前壁，穿刺过程中就可能透过胎盘造成胎盘早剥，使胎盘出血。因此需要及早的处理，以及定期的复查。若是胎盘处于前置状态，这种风险就更大。
因此需要检查好各项指标后，再进行羊水穿刺术，通常可以降低风险。羊水穿刺术后，孕妇需要注意休息，也可以达到降低风险的效果。
