尿道下裂可能和遗传变异、环境污染、母体或者胎盘因素等有关系。
若某些基因出现变异时,可对尿道形成所需要的激素生成造成影响,若所需要的激素不足时,可导致尿道不完全闭合,从而造成尿道下裂。
若在孕期接触了激素或者是某些化学、毒物,比如杀虫剂、农药等有害物质,也有可能会诱发孩子尿道下裂。
若孕妇属于高龄产妇,或者是患有糖尿病以及胎盘重量轻等,或者父亲患有尿道下裂,均有可能会增加孩子尿道下裂的发生率。