生殖器疱疹一般可以使用抗病毒的药物，或者止痛类的药物进行治疗。
生殖器疱疹通常是疱疹病毒感染导致的，所以可以在医生指导下使用抗病毒的药物进行治疗，常用的有伐昔洛韦、泛昔洛韦等，能够减少水疱和溃疡的炎症程度和疾病持续的时间，从而加快水疱和溃疡的愈合，也能够减少疾病的发作几率，同时还能减少传染给其他人群的几率。
出现生殖器疱疹的患者一般会伴有疼痛的症状，如果患者疼痛的症状比较明显，可以在医生的建议下搭配止痛类的药物，比如对乙酰氨基酚、布洛芬等。
