扁桃体炎由于病因不同，也就没有绝对的最快或最有效药物，应该在医生的建议下，根据病情选择药物对症治疗。
细菌感染引起的扁桃体炎，通常可遵医嘱使用清热去火类的药物，如牛黄解毒片、双黄连口服液、清热解毒口服液、黄连上清丸等；再配合使用抗生素，如阿莫西林胶囊、罗红霉素胶囊等药物共同治疗，通常在炎症消退后扁桃体炎症状也会相应减轻。
扁桃体炎如果是经常性的发作，或扁桃体过于肥大影响到呼吸或吞咽等情况，可以选择到正规医院进行扁桃体摘除手术。
