女性生殖器疱疹需要根据初发型、复发型不同，进行系统药物治疗，并使用抗病毒类外用药物等进行治疗。
女性生殖器疱疹如果是初发型，可在医生指导下使用阿昔洛韦片、伐昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗。如果是复发型，可选择间歇疗法，若出现症状或皮损，24小时内可使用相同药物进行治疗，疗程一般为5天。若一年复发超过6次的频繁复发型，通常需要连续口服6-12个月。
女性生殖器疱疹还可以遵医嘱外用阿昔洛韦软膏、喷昔洛韦乳膏等药物进行治疗。如果继发细菌感染，可根据医生建议选用夫西地酸乳膏或莫匹罗星软膏等进行抗感染治疗。
