一般情况下，喉咙一侧吞咽疼痛伴耳深处疼可能是扁桃体炎、中耳炎、舌咽神经痛、感冒等原因引起的，具体原因及治疗方式如下：
由于细菌感染导致扁桃体充血肿胀，可能会导致喉咙一侧吞咽疼痛伴耳深处疼，通常还会出现呼吸不畅的症状。可在医生指导下应用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢丙烯分散片等药物进行治疗。
用不干净的手挖耳朵或耳朵进水引起的感染，炎症刺激导致喉咙一侧吞咽疼痛伴耳深处疼。可在医生指导下应用阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星滴耳液等药物进行治疗。
舌咽神经受到刺激引起阵发性疼痛的疾病，如大笑、咳嗽、打喷嚏、舌咽神经肿瘤等，可能会导致喉咙一侧吞咽疼痛伴耳深处疼，疼痛持续时间较短。可在医生指导下应用卡马西平片、加巴喷丁胶囊等药物进行治疗。
由病毒感染引起的上吸道炎症，咽喉黏膜充血，炎症可能会延至耳部，引起喉咙一侧吞咽疼痛伴耳深处疼。可在医生指导下应用连花清瘟颗粒、感冒灵胶囊等药物治疗。
