打疫苗即接种疫苗。新生儿接种疫苗40天后有脓包的原因以及处理方式主要有以下几方面：
新生儿接种疫苗40天后有脓包，主要是见于接种卡介苗。接种后机体产生细胞免疫以及体液免疫反应，从而出现局部化脓的情况，属于正常生理现象，不会有其他不适症状。可以暂时观察，不需要特殊处理。
新生儿接种疫苗40天后有脓包，可能与接种部位感染有关，还会有疼痛、红肿等症状伴随。建议及时去医院就诊，积极进行血常规、C-反应蛋白等检查明确。必要时，尽早进行干预处理，比如在医师指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等，进行抗感染治疗。
部分新生儿接种疫苗40天后有脓包，可能与免疫缺陷性疾病有关，还会有反复感染、生长发育落后等伴随。建议及时去医院就诊，进行免疫相关检查明确。必要时，在医师指导下使用人免疫球蛋白等进行治疗。
