新生儿转氨酶高部分能自愈，但是部分不能自愈，与导致新生儿转氨酶高的病因有关。
- 新生儿转氨酶高比较常见的原因是新生儿窒息、感染等。部分病情比较轻微的，大部分原发疾病缓解后能够自愈，比如新生儿窒息缓解、感染控制以后，转氨酶可以自行下降。但是需要定期复查，了解转氨酶的变化情况，避免病情加重，降低发生并发症的概率。
- 部分新生儿转氨酶高可能与病毒性肝炎、先天性胆道闭锁，甚至某些遗传代谢性疾病，比如粘多糖病、糖原累积症等有关。大部分不能自愈，需要尽早进行干预处理，主要是积极进行保肝治疗，必要时需要抗病毒治疗。如果存在先天性胆道闭锁，除了转氨酶高以外，还会出现进行性皮肤黄染、排陶土色大便等，需要尽早进行手术治疗，避免出现肝功能衰竭的情况。
