新生儿乙状结肠冗长主要与遗传、环境以及胎儿时期受到致病菌入侵等有关，但是大部分与多种因素有关，而且具体发病机制还不是特别明确。
- 新生儿乙状结肠冗长可能与遗传因素有关。一般家庭成员中有乙状结肠冗长的情况，后代发生乙状结肠冗长的概率会明显增加。
- 新生儿在胎儿时期的发育容易受到环境因素的影响，所以当外界环境不好时，比如外界环境中存在有毒有害性物质、环境中存在放射性物质等，容易导致发育异常，就可能出现乙状结肠冗长的情况。
- 部分新生儿乙状结肠冗长可能与胎儿时期受到致病菌入侵有关。胎儿时期受到致病菌入侵时，容易影响细胞的增生以及分化，从而出现发育异常的情况，就可能导致乙状结肠冗长的情况。
