睑板腺功能障碍的原因有很多，一般认为有以下三个原因，即感染因素、环境因素、全身因素。
主要是表皮葡萄球菌感染，其产生的胆固醇酯酶能分解睑板腺脂质，产生的代谢产物刺激眼睑缘，造成睑缘炎，导致睑板腺堵塞，炎症和过度的角化引起睑板腺缺失，从而出现睑板腺功能障碍。
接触电子产品时间过长、待在空调房或者其他刺激性环境中，会使泪液蒸发过快，导致泪液渗透压增加，泪液的缺乏影响了泪膜的稳定性，从而造成睑板腺功能障碍。
例如干燥综合征，不仅会影响唾液腺、泪腺的分泌，还会影响到睑板腺分泌，使睑板腺堵塞，从而导致睑板腺功能障碍。
此外，导致睑板腺功能障碍的原因还包括年龄增长后，体内激素水平改变引起的睑板腺腺泡萎缩；长期的药物干预影响睑板腺结构等。无论是何种原因，都需要去医院明确诊断后，进行针对性的治疗。
