不同的病菌引起的性病不同，潜伏期也不同，常见的性病有艾滋病、梅毒、生殖器疱疹、尖锐湿疣、淋病等。
急性艾滋病初次感染病毒到在出现早期临床咽痛、盗汗、呕吐、恶心、皮疹、腹泻等症状的这段时间为潜伏期，通常潜伏期为2到4周，但对于无症状的艾滋病患者由于感染病毒的类型、数量、感染途径，人体免疫情况、生活习惯等因素的不同，潜伏期的时间也不同，通常达到6到15年。
当患者感染到梅毒后，通常会在2到4周左右，在梅毒下螺旋体侵入部位出现硬下疳的症状。
生殖器疱疹病毒的潜伏期通常在2周内，在饮酒、劳累后生殖器疱疹易反复。
尖锐湿疣潜伏期通常为3个月左右，在感染病毒大约后3个月就会出疣状异物的症状，如患者免疫力下降时潜伏期也可缩短至3周左右出现症状。
由于淋病大多数都是急性感染，出现症状时间较短，所以通常潜伏期也较短，大约2到10天左右。
