慢阻肺不治疗的后果就是导致呼吸困难引起COPD，最终会导致肺性脑病等全身各个系统的病变，而导致呼吸衰竭引起死亡。一般疾病最终的转归就是死亡。所以呼吸系统的疾病也不例外，如果不治疗疾病就会逐渐加重。当出现广泛的肺部病变引起严重呼吸困难的时候，就会导致机体缺氧。
而缺氧二氧化碳潴留就更加加重了呼吸功能抑制，所以就容易导致呼吸功能衰竭。当血液中缺氧严重的时候，身体的其他各个系统都会受到低氧血症的影响，出现各种病变，比如肺性脑病是因为大脑缺氧导致脑水肿，引起颅内生压升高等一系列病变。肾脏缺氧就会导致肾功能衰竭而引起尿毒症等。心脏缺氧会引起心功能不全。
