肛门擦拭疼痛，可能和痔疮、肛裂、肛周脓肿等病情，需要患者去医院确诊具体病情，再进行保守治疗或手术治疗。
病变基础在于肛管静脉丛曲张以及肛垫下移。一般情况下，患者不会出现肛门擦拭疼痛的症状。但是，如果患者演变为内痔嵌顿、血栓性外痔等特殊病变情况，由于痔核组织受到肛门嵌压，发生血液循环障碍，擦拭肛门的过程中，触碰到病变部位，就会出现疼痛情况。如果患者嵌顿时间短，及早将痔核组织送回肛管，结合痔疮栓等药物，可以改善局部疼痛症状。如果患者嵌顿时间较长，发生痔核组织缺血坏死，就需要手术治疗，主要是通过痔核剥离手术，将坏死组织切除，从而治愈病变。
由于存在肛裂伤口，擦拭肛门过程中，如果触碰到肛裂伤口，则会出现肛门疼痛症状，同时，患者多会出现便血情况。如果肛裂伤口新鲜，可以保守治疗。在保持大便通畅的基础上，清洗肛裂伤口，使用生长因子、痔疮膏等药物，促进肛裂伤口愈合。如果肛裂伤口陈旧，需要通过肛裂切除术，从而治愈病变。
由于各种原因导致细菌、病毒侵袭肛旁组织形成脓肿病变，如果脓肿靠近肛门区域，患者擦拭肛门时触碰到脓肿区域，就会出现肛门疼痛症状。治疗方案以脓肿切开引流术为主，结合抗生素药物治疗（青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类、喹诺酮类抗生素等），确保彻底治愈病变，从而改善患者临床症状。
